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新生兒生理性黃疸的發(fā)生與新生兒膽紅素代謝的特點(diǎn)密切相關(guān)。首先，膽紅素產(chǎn)生的相對(duì)過(guò)多與新生兒在宮內(nèi)低氧環(huán)境中生活，導(dǎo)致紅細(xì)胞數(shù)相對(duì)較多有關(guān)。如果出生時(shí)延遲結(jié)扎臍帶或助產(chǎn)人員有意從臍帶向新生兒擠血，紅細(xì)胞數(shù)量將更多。此外，胎兒紅細(xì)胞壽命較短（70～100天），因此產(chǎn)生的膽紅素也較多。出生后，新生兒開(kāi)始用肺呼吸，血氧分壓升高，過(guò)多的紅細(xì)胞迅速破壞，使血中非結(jié)合膽紅素增加更多。

成人每日生成膽紅素約為65.0μmol/L（3.8mg/kg），而新生兒每日生成膽紅素約為145.4μmol/L（8.5mg/kg），相當(dāng)于成人的2倍。因此，新生兒肝臟代謝膽紅素的負(fù)荷大于成人。

其次，膽紅素與白蛋白聯(lián)結(jié)運(yùn)送的能力不足，這主要與新生兒出生后的短暫階段，有輕重不等的酸中毒有關(guān)。酸中毒會(huì)影響膽紅素與白蛋白聯(lián)結(jié)的數(shù)量。早產(chǎn)兒血中白蛋白偏低，更使膽紅素的聯(lián)結(jié)運(yùn)送延緩。

再者，新生兒肝細(xì)胞內(nèi)缺乏Y蛋白及Z蛋白（只有成人的5～20%），在生后第5日才逐漸合成。這兩種蛋白具有攝取非結(jié)合膽紅素，并轉(zhuǎn)運(yùn)至滑面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)進(jìn)行代謝的功能。由于Y、Z蛋白的合成不足，影響了肝細(xì)胞對(duì)非結(jié)合膽紅素的攝取。

此外，新生兒肝臟的葡萄糖醛酸轉(zhuǎn)移酶和尿嘧啶核苷二磷酸糖脫氫酶（UDpG脫氫酶）不足或受抑制，不能將非結(jié)合膽紅素轉(zhuǎn)變?yōu)榻Y(jié)合膽紅素，以至非結(jié)合膽紅素潴留血中而發(fā)生黃疸。此類(lèi)酶在生后1周左右才開(kāi)始增多，早產(chǎn)兒更晚。

最后，新生兒生后頭幾天，腸道內(nèi)正常菌群尚未建立，因此隨膽汁進(jìn)入腸道的結(jié)合膽紅素不能被還原為糞膽元。另一方面，新生兒腸道中有較多β-葡萄糖醛酸苷酶，能將結(jié)合膽紅素水解為非結(jié)合膽紅素，后者被腸粘膜吸收，經(jīng)門(mén)靜脈返回至肝臟，這是新生兒腸一肝循環(huán)的特點(diǎn)。其結(jié)果是使肝臟代謝膽紅素的負(fù)擔(dān)增加，而致非結(jié)合膽紅素潴留血中。